根据教育部2007年8月20日公布,复旦大学有一级学科国家重点学科11个,二级学科国家重点学科19个,国家重点(培育)学科3个。

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一级学科国家重点学科

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哲学

理论经济学

中国语言文学

新闻传播学

数学

物理学

化学

生物学

电子科学与技术

基础医学

中西医结合

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二级学科国家重点学科

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产业经济学

金融学

政治学理论

国际关系

历史地理学

中国近现代史

计算机软件与理论

内科学(心血管病)

内科学(肾病)

内科学(传染病)

儿科学

神经病学

影像医学与核医学

外科学

眼科学

耳鼻咽喉科学

妇产科学

肿瘤学

流行病学与卫生统计学

药剂学

社会医学与卫生事业管理

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注:2014年2月15日,根据《国务院关于取消和下放一批行政审批项目的决定》(国发〔2014〕5号),教育部取消国家重点学科审批。